Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itih4A6X935 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itih4A6X935 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Itih4A6X935 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itih4A6X935 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itih4A6X935 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itih4A6X935 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itih4A6X935 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Itih4A6X935 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itih4A6X935 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itih4A6X935 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itih4A6X935 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itih4A6X935 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Itih4A6X935 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itih4A6X935 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itih4A6X935 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itih4A6X935 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Itih4A6X935 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itih4A6X935 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itih4A6X935 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itih4A6X935 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itih4A6X935 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itih4A6X935 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itih4A6X935 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itih4A6X935 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itih4A6X935 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itih4A6X935 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itih4A6X935 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itih4A6X935 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itih4A6X935 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itih4A6X935 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itih4A6X935 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Itih4A6X935 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itih4A6X935 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itih4A6X935 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itih4A6X935 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itih4A6X935 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itih4A6X935 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itih4A6X935 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itih4A6X935 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itih4A6X935 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itih4A6X935 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Itih4A6X935 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itih4A6X935 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms