Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD8B2A6NJW9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD8B2A6NJW9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD8B2A6NJW9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD8B2A6NJW9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CD8B2A6NJW9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD8B2A6NJW9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD8B2A6NJW9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD8B2A6NJW9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD8B2A6NJW9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD8B2A6NJW9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD8B2A6NJW9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD8B2A6NJW9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD8B2A6NJW9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD8B2A6NJW9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD8B2A6NJW9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD8B2A6NJW9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD8B2A6NJW9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD8B2A6NJW9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD8B2A6NJW9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD8B2A6NJW9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD8B2A6NJW9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms