Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMX3A6NHT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX3A6NHT5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMX3A6NHT5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMX3A6NHT5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HMX3A6NHT5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX3A6NHT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX3A6NHT5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX3A6NHT5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX3A6NHT5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX3A6NHT5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMX3A6NHT5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HMX3A6NHT5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HMX3A6NHT5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMX3A6NHT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMX3A6NHT5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMX3A6NHT5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMX3A6NHT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMX3A6NHT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMX3A6NHT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMX3A6NHT5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMX3A6NHT5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMX3A6NHT5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HMX3A6NHT5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMX3A6NHT5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HMX3A6NHT5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMX3A6NHT5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMX3A6NHT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms