Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
XIRP2A4UGR9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
XIRP2A4UGR9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
XIRP2A4UGR9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
XIRP2A4UGR9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XIRP2A4UGR9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
XIRP2A4UGR9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
XIRP2A4UGR9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
XIRP2A4UGR9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
XIRP2A4UGR9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
XIRP2A4UGR9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
XIRP2A4UGR9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XIRP2A4UGR9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
XIRP2A4UGR9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XIRP2A4UGR9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XIRP2A4UGR9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
XIRP2A4UGR9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XIRP2A4UGR9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
XIRP2A4UGR9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
XIRP2A4UGR9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XIRP2A4UGR9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
XIRP2A4UGR9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XIRP2A4UGR9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP2A4UGR9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP2A4UGR9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XIRP2A4UGR9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XIRP2A4UGR9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XIRP2A4UGR9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XIRP2A4UGR9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XIRP2A4UGR9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XIRP2A4UGR9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XIRP2A4UGR9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XIRP2A4UGR9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP2A4UGR9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XIRP2A4UGR9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XIRP2A4UGR9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP2A4UGR9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP2A4UGR9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XIRP2A4UGR9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
XIRP2A4UGR9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XIRP2A4UGR9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XIRP2A4UGR9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XIRP2A4UGR9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
XIRP2A4UGR9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
XIRP2A4UGR9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
XIRP2A4UGR9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms