Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC66A2RUB6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC66A2RUB6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC66A2RUB6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC66A2RUB6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC66A2RUB6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC66A2RUB6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC66A2RUB6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC66A2RUB6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC66A2RUB6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC66A2RUB6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC66A2RUB6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC66A2RUB6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC66A2RUB6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC66A2RUB6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC66A2RUB6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC66A2RUB6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC66A2RUB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC66A2RUB6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC66A2RUB6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC66A2RUB6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms