Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
A0A087X0T9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
A0A087X0T9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
A0A087X0T9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A087X0T9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
A0A087X0T9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
A0A087X0T9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087X0T9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087X0T9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
A0A087X0T9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
A0A087X0T9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
A0A087X0T9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
A0A087X0T9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
A0A087X0T9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
A0A087X0T9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
A0A087X0T9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
A0A087X0T9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
A0A087X0T9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
A0A087X0T9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
A0A087X0T9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0T9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
A0A087X0T9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087X0T9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
A0A087X0T9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
A0A087X0T9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
A0A087X0T9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
A0A087X0T9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
A0A087X0T9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
A0A087X0T9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A087X0T9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A087X0T9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms