Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28171A0A087WQ19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28171A0A087WQ19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28171A0A087WQ19 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28171A0A087WQ19 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28171A0A087WQ19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28171A0A087WQ19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28171A0A087WQ19 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28171A0A087WQ19 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28171A0A087WQ19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28171A0A087WQ19 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28171A0A087WQ19 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm28171A0A087WQ19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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