Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb6Q9Z0T9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itgb6Q9Z0T9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Itgb6Q9Z0T9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms