Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXND1Q9Y4D7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXND1Q9Y4D7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms