Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nme3Q9WV85 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nme3Q9WV85 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nme3Q9WV85 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms