Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stub1Q9WUD1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Stub1Q9WUD1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stub1Q9WUD1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms