Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLEC4AQ9UMR7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLEC4AQ9UMR7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms