Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syt6Q9R0N8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syt6Q9R0N8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms