Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt71Q9R0H5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt71Q9R0H5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt71Q9R0H5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms