Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpc1Q9QZF2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpc1Q9QZF2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms