Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpc3Q9QZC1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc3Q9QZC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc3Q9QZC1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms