Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11aQ9QYE3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bcl11aQ9QYE3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bcl11aQ9QYE3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms