Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kifc1Q9QWT9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kifc1Q9QWT9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms