Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZDHHC3Q9NYG2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms