Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BSDC1Q9NW68 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BSDC1Q9NW68 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BSDC1Q9NW68 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321.5 ms