Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A20Q9NP91 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A20Q9NP91 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A20Q9NP91 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC6A20Q9NP91 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC6A20Q9NP91 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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