Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gkap1Q9JMB0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gkap1Q9JMB0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms