Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PnkpQ9JLV6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PnkpQ9JLV6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PnkpQ9JLV6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms