Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpa33Q9JKA5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpa33Q9JKA5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms