Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Bco1Q9JJS6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Bco1Q9JJS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Bco1Q9JJS6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bco1Q9JJS6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bco1Q9JJS6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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