Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a4Q9JIS8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a4Q9JIS8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms