Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl28Q9JIL2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl28Q9JIL2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms