Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn19Q9ET38 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn19Q9ET38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms