Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snap29Q9ERB0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snap29Q9ERB0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms