Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc46a3Q9DC26 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc46a3Q9DC26 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms