Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Swt1Q9DBQ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Swt1Q9DBQ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms