Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhl40Q9D783 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhl40Q9D783 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 602.2 ms