Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pfn4Q9D6I3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms