Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tspan11Q9D1D1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms