Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lsm12Q9D0R8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lsm12Q9D0R8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms