Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx17Q9D0I4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx17Q9D0I4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx17Q9D0I4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms