Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Shisa9Q9CZN4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Shisa9Q9CZN4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms