Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alpk1Q9CXB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alpk1Q9CXB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alpk1Q9CXB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alpk1Q9CXB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alpk1Q9CXB8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alpk1Q9CXB8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms