Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sft2d3Q9CSV6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sft2d3Q9CSV6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms