Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd1Q9CR42 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd1Q9CR42 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd1Q9CR42 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms