Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVK-6Q9BXR3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVK-6Q9BXR3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms