Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RBM42Q9BTD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RBM42Q9BTD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RBM42Q9BTD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.6 ms