Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT92

TCHP, Trichoplein keratin filament-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHPQ9BT92 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCHPQ9BT92 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCHPQ9BT92 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms