Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SELENOSQ9BQE4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SELENOSQ9BQE4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms