Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsnaxip1Q99P25 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsnaxip1Q99P25 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms