Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a6bQ99N09 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a6bQ99N09 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms