Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf34Q99KR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf34Q99KR6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf34Q99KR6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms