Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krcc1Q99JT5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krcc1Q99JT5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms