Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATXN2Q99700 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN2Q99700 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms