Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms